chromodomain helicase DNA binding protein 8

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同義遺伝子名

Chd8, mKIAA1564, Duplin, 5830451P18Rik, chromodomain helicase DNA binding protein 8, AU015341, HELSNF1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:102.50 小脳:36.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:57.30 脊柱:- 網膜:192.90 目:235.50 動脈:84.40 静脈:- リンパ節:10.80 末梢血:172.50 脾臓:39.50 胸腺:108.70 骨髄:- 脂肪:- 骨:125.20 皮膚:71.30
GeneChip 大脳:9.01 小脳:9.32 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.72 脊柱:9.02 網膜:8.69 目:8.07 動脈:- 静脈:8.72 リンパ節:9.77 末梢血:- 脾臓:9.98 胸腺:- 骨髄:9.27 脂肪:8.43 骨:9.11 皮膚:9.31
CAGE nodata
RNA-seq 大脳:6.94 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:43.60 胎盤:27.60 前立腺:61.80 卵巣:172.40 精巣:29.60 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:65.50 腸:- 結腸:-     肝臓:9.10        肺:50.20    膀胱:- 腎臓:32.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:28.10 乳腺:62 唾液腺:-
GeneChip 子宮:9.40 胎盤:8.84 前立腺:9.26 卵巣:9.42 精巣:8.51 心臓:8.28 骨格筋:8.50 食道:- 胃:8.72 腸:8.85 結腸:- 肝臓:8.35 肺:8.97 膀胱:8.82 腎臓:8.30 下垂体:9.47 甲状腺:- 副腎:9.76 膵臓:8.70 乳腺:8.81 唾液腺:10.04
CAGE nodata
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.78 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.62        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_201637
Gene ID 67772
Unigene ID Mm.289934
Probe set ID 1437297_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000053754

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_001170629, NM_020920
ラット[1]  NM_022933, NM_020920

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000953  Chromo domain
IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7490078
8889548
10349636
10725249
10921920
10922068
11042159
11076861
11217851
11744694
12466851
12477932
14610273
14621295
14681479
15367660
16141072
16141073
16949368
18287559
19151705
20739623
21267068
21677750
22083958
22922362

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043044  ATP-dependent chromatin remodeling
GO:0016568  chromatin modification
GO:0032508  DNA duplex unwinding
GO:0001701  in utero embryonic development
GO:0043066  negative regulation of apoptosis
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0030178  negative regulation of Wnt receptor signaling pathway
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045945  positive regulation of transcription from RNA polymerase III promoter
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent
GO:0016055  Wnt receptor signaling pathway
GO:0060070  Wnt receptor signaling pathway through beta-catenin

Cellular Component

GO:0071339  MLL1 complex
GO:0005634  nucleus
GO:0043234  protein complex

Molecular Function

GO:0070016  armadillo repeat domain binding
GO:0005524  ATP binding
GO:0008013  beta-catenin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0003678  DNA helicase activity
GO:0008094  DNA-dependent ATPase activity
GO:0004386  helicase activity
GO:0042393  histone binding
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0016817  hydrolase activity, acting on acid anhydrides
GO:0035064  methylated histone residue binding
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0002039  p53 binding
GO:0005515  protein binding