collagen triple helix repeat containing 1

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同義遺伝子名

Cthrc1, 1110014B07Rik, collagen triple helix repeat containing 1

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:17.40

小脳:18.40

脳幹:63.60

脳梁:-

松果体:257.80

末梢神経:-

脊柱:94.60

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:12.80

脂肪:-

骨:62.60

皮膚:63.30

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:1.75

小脳:-

脳幹:2.60

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:2.68

網膜:-

目:-

動脈:0.46

静脈:-

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:-

骨:1.69

皮膚:2.07

RNA-seq

大脳:2.54

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:43.60

胎盤:-

前立腺:30.90

卵巣:11.50

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:32.70

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:12.90

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:3.30

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:1.32

胎盤:1.96

前立腺:0.63

卵巣:1.42

精巣:0

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:0.67

腸:0

結腸:0

肝臓:0

肺:1.73

膀胱:0.77

腎臓:-

下垂体:0.99

甲状腺:-

副腎:1.70

膵臓:0

乳腺:1.48

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:1.01

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:0

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_026778
Gene ID	68588
Unigene ID	Mm.41556
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSMUSG00000054196

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]	NM_138455
ラット[1]	NM_172333

染色体

15B3.1 [38,908,478 - 38,918,667]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0016477	cell migration
GO:0090103	cochlea morphogenesis
GO:0090177	establishment of planar polarity involved in neural tube closure
GO:0060122	inner ear receptor stereocilium organization
GO:0090090	negative regulation of Wnt receptor signaling pathway through beta-catenin
GO:0043932	ossification involved in bone remodeling
GO:0045669	positive regulation of osteoblast differentiation
GO:0033690	positive regulation of osteoblast proliferation
GO:0032092	positive regulation of protein binding
GO:0060071	Wnt receptor signaling pathway, planar cell polarity pathway

Cellular Component

GO:0005581	collagen
GO:0005737	cytoplasm
GO:0031012	extracellular matrix
GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space
GO:0005578	proteinaceous extracellular matrix

Molecular Function

GO:0005109	frizzled binding
GO:0005515	protein binding
GO:0017147	Wnt-protein binding

collagen triple helix repeat containing 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function