arginine glutamic acid dipeptide (RE) repeats

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同義遺伝子名

AI414665, Kiaa0458, Atr2, Rere, 1110033A15Rik, mKIAA0458, atrophin-2, ARG, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, ATN1L, DNB1, arginine glutamic acid dipeptide (RE) repeats, Atrophin-2, ARP, AW742570

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:151.10 小脳:55.30 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:114.70 脊柱:- 網膜:160.70 目:152 動脈:- 静脈:- リンパ節:32.40 末梢血:- 脾臓:92.20 胸腺:177.80 骨髄:12.80 脂肪:1063.60 骨:25 皮膚:39.60
GeneChip 大脳:9.14 小脳:9.35 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.38 脊柱:9.45 網膜:9.08 目:9.18 動脈:- 静脈:8.84 リンパ節:9.33 末梢血:- 脾臓:9.92 胸腺:- 骨髄:9.11 脂肪:9.09 骨:9.05 皮膚:9.13
CAGE 大脳:4.55 小脳:- 脳幹:4.29 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:4.45 網膜:- 目:- 動脈:4.95 静脈:- リンパ節:5.00 末梢血:- 脾臓:3.79 胸腺:3.59 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.71 皮膚:4.69
RNA-seq 大脳:11.87 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:220.90 前立腺:92.60 卵巣:23 精巣:36.90 心臓:37.20 骨格筋:35.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:123.40     肝臓:9.10        肺:70.30    膀胱:- 腎臓:56.40 下垂体:38.80 甲状腺:112.50 副腎:- 膵臓:197 乳腺:146.90 唾液腺:216
GeneChip 子宮:10.09 胎盤:9.15 前立腺:10.12 卵巣:9.74 精巣:7.92 心臓:8.09 骨格筋:9.34 食道:- 胃:8.72 腸:9.42 結腸:- 肝臓:7.65 肺:9.16 膀胱:9.15 腎臓:9.58 下垂体:9.93 甲状腺:- 副腎:9.99 膵臓:8.65 乳腺:9.29 唾液腺:9.34
CAGE 子宮:4.38 胎盤:4.11 前立腺:4.08 卵巣:4.59 精巣:3.37 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.59 腸:3.86 結腸:3.87     肝臓:3.44    肺:4.43 膀胱:4.57 腎臓:- 下垂体:4.47 甲状腺:- 副腎:4.59 膵臓:3.94 乳腺:4.37 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:5.25 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.31        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001085492
Gene ID 68703
Unigene ID Mm.291274
Probe set ID 1454670_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000039852

オーソログ対応遺伝子

ヒト[12]  NM_001042681, NM_001042682, NM_012102
ラット [0]  

染色体

4E2  [149,655,755  -  149,996,075]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR017993  Atrophin-1
IPR002951  Atrophin-like
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related
IPR001005  SANT, DNA-binding

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
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17967808
18287559
18799693
19131340
20164929
21267068
21677750
22510986
23451234

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0007275  multicellular organismal development
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0000118  histone deacetylase complex
GO:0005739  mitochondrion
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0005515  protein binding
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity
GO:0008270  zinc ion binding