small nuclear ribonucleoprotein polypeptide F

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同義遺伝子名

2010013O18Rik, SmF, snRNP-F, Sm protein F, Sm-F, Snrpf, small nuclear ribonucleoprotein polypeptide F, Small nuclear ribonucleoprotein F, SMF

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:6.90 小脳:18.40 脳幹:31.80 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:21.60 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.40 小脳:- 脳幹:3.33 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.40 網膜:- 目:- 動脈:3.52 静脈:- リンパ節:4.07 末梢血:- 脾臓:4.41 胸腺:4.26 骨髄:- 脂肪:- 骨:4.08 皮膚:4.00
RNA-seq 大脳:11.74 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:258.60 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:110.90 結腸:-     肝臓:-        肺:20.10    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:9.40 乳腺:3.30 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.72 胎盤:4.09 前立腺:3.45 卵巣:3.82 精巣:4.96 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.72 腸:2.33 結腸:3.62     肝臓:3.18    肺:3.44 膀胱:3.41 腎臓:- 下垂体:3.67 甲状腺:- 副腎:3.38 膵臓:3.64 乳腺:3.55 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:11.88 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:7.00        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_027246
Gene ID 69878
Unigene ID Mm.259642
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000020018

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_003095
ラット[1]  NM_001126091

染色体

10C2  [93,045,774  -  93,052,451]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type
IPR016487  Small nuclear ribonucleoprotein SmF

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
16033648
16141072
16141073
16783635
21677750
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006397  mRNA processing
GO:0006396  RNA processing
GO:0008380  RNA splicing

Cellular Component

GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005634  nucleus
GO:0030529  ribonucleoprotein complex
GO:0030532  small nuclear ribonucleoprotein complex
GO:0005681  spliceosomal complex
GO:0005689  U12-type spliceosomal complex
GO:0005683  U7 snRNP

Molecular Function

GO:0003723  RNA binding