polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

PNPase, PNPase old-35, polynucleotide phosphorylase, Old35, 3'-5' RNA exonuclease OLD35, 1200003F12Rik, Polynucleotide phosphorylase-like protein, Pnpt1, Pnpase, PNPase 1, 3'-5' RNA exonuclease, Pnptl1, polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:52.10 小脳:- 脳幹:31.80 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:38.20 脊柱:47.30 網膜:32.10 目:30.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:43.20 末梢血:287.50 脾臓:79 胸腺:49.40 骨髄:294.90 脂肪:- 骨:- 皮膚:118.80
GeneChip 大脳:7.10 小脳:7.09 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.21 脊柱:7.08 網膜:7.54 目:7.12 動脈:- 静脈:7.31 リンパ節:8.08 末梢血:- 脾臓:7.85 胸腺:- 骨髄:8.39 脂肪:7.81 骨:8.15 皮膚:7.42
CAGE nodata
RNA-seq 大脳:2.03 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:218.10 胎盤:55.20 前立腺:92.60 卵巣:57.50 精巣:96.10 心臓:55.80 骨格筋:71 食道:- 胃:- 腸:37 結腸:-     肝臓:36.20        肺:80.30    膀胱:132.40 腎臓:32.20 下垂体:38.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:187.60 乳腺:39.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.92 胎盤:8.12 前立腺:7.39 卵巣:8.04 精巣:6.85 心臓:7.89 骨格筋:7.90 食道:- 胃:7.86 腸:8.11 結腸:- 肝臓:8.31 肺:7.31 膀胱:7.26 腎臓:7.85 下垂体:7.31 甲状腺:- 副腎:8.43 膵臓:6.27 乳腺:7.68 唾液腺:7.24
CAGE nodata
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.35 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.72        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_027869
Gene ID 71701
Unigene ID Mm.211131
Probe set ID 1452676_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000020464

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_033109
ラット[1]  NM_001142371

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR004087  K Homology
IPR004088  K Homology, type 1
IPR012340  Nucleic acid-binding, OB-fold
IPR016027  Nucleic acid-binding, OB-fold-like
IPR012162  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase
IPR003029  Ribosomal protein S1, RNA binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12419256
12466851
12477932
12904583
15489334
16033648
16141072
16141073
16602821
16966381
18614015
20691904
21677750
22411789
23084290

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0034599  cellular response to oxidative stress
GO:0000958  mitochondrial mRNA catabolic process
GO:0000965  mitochondrial RNA 3'-end processing
GO:0000964  mitochondrial RNA 5'-end processing
GO:0000957  mitochondrial RNA catabolic process
GO:0070584  mitochondrion morphogenesis
GO:0006402  mRNA catabolic process
GO:0006397  mRNA processing
GO:0045926  negative regulation of growth
GO:0071042  nuclear polyadenylation-dependent mRNA catabolic process
GO:0000962  positive regulation of mitochondrial RNA catabolic process
GO:0051260  protein homooligomerization
GO:0070207  protein homotrimerization
GO:0043457  regulation of cellular respiration
GO:0006401  RNA catabolic process
GO:0043631  RNA polyadenylation
GO:0006396  RNA processing
GO:0006810  transport

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0016020  membrane
GO:0045025  mitochondrial degradosome
GO:0005758  mitochondrial intermembrane space
GO:0005739  mitochondrion
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0000175  3'-5'-exoribonuclease activity
GO:0004527  exonuclease activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0035198  miRNA binding
GO:0004518  nuclease activity
GO:0016779  nucleotidyltransferase activity
GO:0034046  poly(G) RNA binding
GO:0008266  poly(U) RNA binding
GO:0004654  polyribonucleotide nucleotidyltransferase activity
GO:0003723  RNA binding
GO:0016740  transferase activity