suppressor of defective silencing 3 homolog (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

mSds3, AU067672, 2400003N08Rik, Sds3, Suds3, RIKEN cDNA 2400003N08 gene

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:64.30 小脳:55.30 脳幹:127.10 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:57.30 脊柱:94.60 網膜:128.60 目:76 動脈:84.40 静脈:- リンパ節:54 末梢血:14.40 脾臓:26.30 胸腺:69.20 骨髄:89.80 脂肪:- 骨:50.10 皮膚:63.30
GeneChip 大脳:9.55 小脳:10.03 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:9.61 脊柱:9.48 網膜:9.72 目:9.94 動脈:- 静脈:8.80 リンパ節:9.08 末梢血:- 脾臓:9.51 胸腺:- 骨髄:9.28 脂肪:9.22 骨:9.16 皮膚:9.25
CAGE 大脳:3.50 小脳:- 脳幹:3.55 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.38 網膜:- 目:- 動脈:3.18 静脈:- リンパ節:3.00 末梢血:- 脾臓:3.24 胸腺:3.13 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.10 皮膚:3.72
RNA-seq 大脳:35.37 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:174.50 胎盤:41.40 前立腺:- 卵巣:23 精巣:7.40 心臓:74.40 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:73.90 結腸:70.50     肝臓:72.40        肺:50.20    膀胱:- 腎臓:56.40 下垂体:- 甲状腺:112.50 副腎:- 膵臓:75.10 乳腺:39.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:9.89 胎盤:8.25 前立腺:9.54 卵巣:9.57 精巣:9.15 心臓:9.91 骨格筋:10.06 食道:- 胃:9.43 腸:9.72 結腸:- 肝臓:9.53 肺:9.15 膀胱:9.39 腎臓:9.80 下垂体:9.22 甲状腺:- 副腎:9.17 膵臓:9.08 乳腺:9.25 唾液腺:9.13
CAGE 子宮:3.13 胎盤:3.34 前立腺:3.72 卵巣:3.10 精巣:4.66 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.00 腸:3.46 結腸:3.42     肝臓:4.16    肺:3.13 膀胱:3.37 腎臓:- 下垂体:3.05 甲状腺:- 副腎:3.15 膵臓:3.61 乳腺:2.97 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:13.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:19.21        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_178622
Gene ID 71954
Unigene ID Mm.34456
Probe set ID 1427896_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000066900

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_022491
ラット[2]  NM_022491

染色体

5F  [117,541,691  -  117,566,002]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11044607
11076861
11125038
11217851
11909966
12466851
12477932
12520002
14522945
15489224
15489334
15782199
16141072
16141073
16767157
21490601
22083510
22716292
23123966

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006915  apoptosis
GO:0016568  chromatin modification
GO:0016575  histone deacetylation
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0043065  positive regulation of apoptosis
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus
GO:0016580  Sin3 complex

Molecular Function

GO:0019899  enzyme binding
GO:0004407  histone deacetylase activity
GO:0042826  histone deacetylase binding
GO:0042802  identical protein binding
GO:0005515  protein binding
GO:0042803  protein homodimerization activity