calponin 3, acidic

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同義遺伝子名

Calponin, acidic isoform, 1600014M03Rik, C85854, Cnn3, calponin 3, acidic, Calponin-3

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:198 小脳:350 脳幹:317.80 脳梁:- 松果体:515.60 末梢神経:535 脊柱:189.10 網膜:771.50 目:296.30 動脈:84.40 静脈:- リンパ節:- 末梢血:14.40 脾臓:26.30 胸腺:335.90 骨髄:12.80 脂肪:212.70 骨:288.10 皮膚:364.20
GeneChip 大脳:10.34 小脳:10.87 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:11.99 脊柱:11.19 網膜:10.91 目:11.73 動脈:- 静脈:12.87 リンパ節:11.27 末梢血:- 脾臓:11.15 胸腺:- 骨髄:9.95 脂肪:9.88 骨:10.60 皮膚:11.53
CAGE 大脳:3.95 小脳:- 脳幹:4.03 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:4.54 網膜:- 目:- 動脈:4.42 静脈:- リンパ節:4.08 末梢血:- 脾臓:3.16 胸腺:4.49 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.44 皮膚:4.27
RNA-seq 大脳:17.75 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:1265.10 胎盤:331.40 前立腺:123.50 卵巣:275.80 精巣:170 心臓:241.80 骨格筋:177.50 食道:- 胃:425.50 腸:- 結腸:141     肝臓:117.70        肺:210.90    膀胱:860.40 腎臓:257.90 下垂体:594.20 甲状腺:- 副腎:424.40 膵臓:37.50 乳腺:153.40 唾液腺:-
GeneChip 子宮:12 胎盤:11.86 前立腺:10.79 卵巣:12.33 精巣:7.26 心臓:9.87 骨格筋:9.70 食道:- 胃:11.77 腸:10.34 結腸:- 肝臓:11.12 肺:11.85 膀胱:12.45 腎臓:11.12 下垂体:11.59 甲状腺:- 副腎:11.97 膵臓:10.63 乳腺:11.03 唾液腺:11.63
CAGE 子宮:4.47 胎盤:5.00 前立腺:4.79 卵巣:4.93 精巣:2.19 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:4.94 腸:3.57 結腸:3.97     肝臓:4.88    肺:4.56 膀胱:4.93 腎臓:- 下垂体:4.08 甲状腺:- 副腎:4.74 膵臓:3.68 乳腺:3.70 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:7.77 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:18.73        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_028044
Gene ID 71994
Unigene ID Mm.275555
Probe set ID 1436836_x_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000053931

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_001839
ラット[1]  NM_001839

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001997  Calponin
IPR016146  Calponin-homology
IPR001715  Calponin-like actin-binding
IPR003096  SM22/calponin

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10512203
10725249
10922068
11042159
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11591653
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15618518
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16141072
16141073
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17332066
17967808
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18799693
20181831
20534673
20861310
21267068
21327095
22083510
22922362
23276748
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0031032  actomyosin structure organization
GO:0032780  negative regulation of ATPase activity

Cellular Component

GO:0043025  cell soma
GO:0030425  dendrite
GO:0043197  dendritic spine
GO:0014069  postsynaptic density

Molecular Function

GO:0003779  actin binding
GO:0005516  calmodulin binding
GO:0008017  microtubule binding
GO:0005515  protein binding