sorting nexin 6

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同義遺伝子名

sorting nexin 6, Snx6, 2810425K19Rik, 2610032J07Rik, C85963, AU018928, Sorting nexin-6, 2010006G21Rik

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:8.23 小脳:8.21 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:9.86 脊柱:8.53 網膜:7.79 目:8.59 動脈:- 静脈:9.96 リンパ節:9.26 末梢血:- 脾臓:8.82 胸腺:- 骨髄:8.58 脂肪:8.98 骨:8.79 皮膚:8.75
CAGE 大脳:3.52 小脳:- 脳幹:3.67 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.56 網膜:- 目:- 動脈:3.63 静脈:- リンパ節:4.40 末梢血:- 脾臓:3.28 胸腺:3.74 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.25 皮膚:3.61
RNA-seq 大脳:5.24 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:9.52 胎盤:9.85 前立腺:9.09 卵巣:9.35 精巣:7.30 心臓:8.08 骨格筋:8.33 食道:- 胃:11.02 腸:8.95 結腸:- 肝臓:7.59 肺:8.94 膀胱:9.24 腎臓:10.11 下垂体:8.79 甲状腺:- 副腎:8.32 膵臓:8.44 乳腺:8.85 唾液腺:7.97
CAGE 子宮:4.12 胎盤:4.08 前立腺:3.96 卵巣:4.01 精巣:2.75 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:5.29 腸:3.88 結腸:4.14     肝臓:3.36    肺:3.96 膀胱:3.73 腎臓:- 下垂体:3.74 甲状腺:- 副腎:3.69 膵臓:3.49 乳腺:3.56 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:3.77 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.04        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_026998
Gene ID 72183
Unigene ID -
Probe set ID 1429497_s_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000005656

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_021249, NM_152233
ラット[1]  NM_001108711, NM_152233

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10725249
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
14610273
15489334
15782199
16141072
16141073
17967808
18523162
18799693
21266196
21267068
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007154  cell communication
GO:0006886  intracellular protein transport
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0030512  negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
GO:0015031  protein transport
GO:0042147  retrograde transport, endosome to Golgi
GO:0006810  transport

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0031410  cytoplasmic vesicle
GO:0031901  early endosome membrane
GO:0005768  endosome
GO:0043231  intracellular membrane-bounded organelle
GO:0016020  membrane
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0008289  lipid binding
GO:0035091  phosphoinositide binding
GO:0042803  protein homodimerization activity