pleckstrin homology domain containing, family F (with FYVE domain) member 1

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同義遺伝子名

1810013P09Rik, Lapf, APPD, ZFYVE15, PHAFIN1, PH domain-containing family F member 1, LAPF, Plekhf1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:6.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:76.40 脊柱:- 網膜:- 目:7.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:54 末梢血:- 脾臓:65.80 胸腺:9.90 骨髄:12.80 脂肪:- 骨:- 皮膚:15.80
GeneChip 大脳:6.76 小脳:8.56 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:6.98 脊柱:8.45 網膜:5.94 目:7.47 動脈:- 静脈:8.32 リンパ節:6.72 末梢血:- 脾臓:6.66 胸腺:- 骨髄:6.60 脂肪:8.24 骨:7.20 皮膚:7.07
CAGE 大脳:1.93 小脳:- 脳幹:1.67 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:1.66 網膜:- 目:- 動脈:2.11 静脈:- リンパ節:0.71 末梢血:- 脾臓:0.52 胸腺:1.90 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.30 皮膚:1.75
RNA-seq 大脳:2.23 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:13.80 前立腺:- 卵巣:- 精巣:7.40 心臓:74.40 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:27.20        肺:120.50    膀胱:- 腎臓:48.40 下垂体:25.80 甲状腺:112.50 副腎:- 膵臓:18.80 乳腺:75.10 唾液腺:54
GeneChip 子宮:7.20 胎盤:7.74 前立腺:9.44 卵巣:8.76 精巣:7.08 心臓:9.02 骨格筋:8.53 食道:- 胃:7.79 腸:7.24 結腸:- 肝臓:8.45 肺:7.79 膀胱:9.10 腎臓:8.49 下垂体:6.42 甲状腺:- 副腎:6.63 膵臓:7.34 乳腺:8.67 唾液腺:8.59
CAGE 子宮:1.16 胎盤:1.74 前立腺:2.28 卵巣:1.88 精巣:1.18 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:0 腸:3.07 結腸:2.39     肝臓:2.09    肺:1.38 膀胱:2.64 腎臓:- 下垂体:0.70 甲状腺:- 副腎:1.17 膵臓:2.90 乳腺:2.99 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.64 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.55        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_024413
Gene ID 72287
Unigene ID Mm.333798
Probe set ID 1424671_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000074170

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_024310
ラット[1]  NM_001013148

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001849  Pleckstrin homology
IPR000306  Zinc finger, FYVE-type
IPR011011  Zinc finger, FYVE/PHD-type
IPR013083  Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
15489334
16141072
16141073
16188880
16919269
17967808
18799693
21267068

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006915  apoptosis
GO:0007032  endosome organization
GO:0010508  positive regulation of autophagy
GO:0046902  regulation of mitochondrial membrane permeability
GO:0016050  vesicle organization

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005768  endosome
GO:0005764  lysosome
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0046872  metal ion binding
GO:0032266  phosphatidylinositol 3-phosphate binding
GO:0070273  phosphatidylinositol-4-phosphate binding
GO:0010314  phosphatidylinositol-5-phosphate binding
GO:0005543  phospholipid binding