poly(A)-specific ribonuclease (deadenylation nuclease)

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同義遺伝子名

Poly(A)-specific ribonuclease PARN, 1200003I18Rik, Parn, Polyadenylate-specific ribonuclease, DAN

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:85.10 小脳:- 脳幹:31.80 脳梁:- 松果体:257.80 末梢神経:19.10 脊柱:94.60 網膜:64.30 目:60.80 動脈:168.80 静脈:- リンパ節:32.40 末梢血:244.40 脾臓:26.30 胸腺:39.50 骨髄:25.60 脂肪:- 骨:50.10 皮膚:110.80
GeneChip 大脳:6.95 小脳:6.52 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:6.96 脊柱:7.16 網膜:6.57 目:6.52 動脈:- 静脈:7.22 リンパ節:7.51 末梢血:- 脾臓:7.27 胸腺:- 骨髄:7.05 脂肪:7.49 骨:7.04 皮膚:7.38
CAGE 大脳:3.21 小脳:- 脳幹:3.15 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.13 網膜:- 目:- 動脈:3.69 静脈:- リンパ節:3.88 末梢血:- 脾臓:3.46 胸腺:3.63 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.02 皮膚:3.84
RNA-seq 大脳:5.93 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:174.50 胎盤:138.10 前立腺:30.90 卵巣:34.50 精巣:88.70 心臓:37.20 骨格筋:- 食道:- 胃:98.20 腸:- 結腸:35.20     肝臓:45.30        肺:130.50    膀胱:66.20 腎臓:32.20 下垂体:129.20 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:93.80 乳腺:78.40 唾液腺:54
GeneChip 子宮:7.78 胎盤:8.13 前立腺:7.14 卵巣:7.67 精巣:7.99 心臓:6.34 骨格筋:6.51 食道:- 胃:6.91 腸:6.79 結腸:- 肝臓:7.31 肺:6.94 膀胱:7.27 腎臓:6.93 下垂体:7.64 甲状腺:- 副腎:7.48 膵臓:6.93 乳腺:7.31 唾液腺:7.35
CAGE 子宮:3.65 胎盤:3.52 前立腺:3.28 卵巣:3.79 精巣:2.46 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.21 腸:3.05 結腸:3.08     肝臓:3.34    肺:3.73 膀胱:3.75 腎臓:- 下垂体:3.63 甲状腺:- 副腎:3.61 膵臓:3.45 乳腺:3.13 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.98 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:6.92        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_028761
Gene ID 74108
Unigene ID Mm.182350
Probe set ID 1425422_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000022685

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001134477, NM_001242992, NM_002582
ラット[2]  NM_001134477, NM_001242992, NM_002582

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
12904583
14610273
15489334
15618518
15782199
16141072
16141073
17785461
18287559
18337750
18641416
19217398
22727665
22956911

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006402  mRNA catabolic process
GO:0000184  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0000289  nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0004527  exonuclease activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0004518  nuclease activity
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0004535  poly(A)-specific ribonuclease activity
GO:0005515  protein binding
GO:0019901  protein kinase binding
GO:0003723  RNA binding