HOP homeobox

同義遺伝子名

Obl, homeobox only domain, AW490897, Hdop, Cameo, 1200015P04Rik, Homeobox-only protein, Hod, Hop, Odd homeobox protein 1, AI848177, mOB1, 1110018K11Rik, Toto, Homeodomain-only protein, Ob1, 2300002F06Rik

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:33

小脳:36.80

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:47.30

網膜:64.30

目:38

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:39.50

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:25

皮膚:63.30

GeneChip

大脳:7.95

小脳:10.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:10.36

脊柱:9.56

網膜:6.52

目:7.74

動脈:-

静脈:9.67

リンパ節:7.52

末梢血:-

脾臓:7.11

胸腺:-

骨髄:7.09

脂肪:8.02

骨:6.90

皮膚:9.76

CAGE

大脳:4.93

小脳:-

脳幹:4.18

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:4.97

網膜:-

目:-

動脈:2.38

静脈:-

リンパ節:3.34

末梢血:-

脾臓:2.80

胸腺:1.95

骨髄:-

脂肪:-

骨:1.84

皮膚:4.95

RNA-seq

大脳:17.89

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:43.60

胎盤:27.60

前立腺:-

卵巣:-

精巣:7.40

心臓:260.40

骨格筋:35.50

食道:-

胃:-

腸:443.70

結腸:35.20

肝臓:63.40

肺:80.30

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:46.90

乳腺:3.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.90

胎盤:8.59

前立腺:10.59

卵巣:6.64

精巣:6.64

心臓:11.05

骨格筋:6.58

食道:-

胃:9.61

腸:8.31

結腸:-

肝臓:9.36

肺:12.74

膀胱:9.26

腎臓:6.38

下垂体:6.77

甲状腺:-

副腎:4.93

膵臓:6.24

乳腺:6.60

唾液腺:6.85

CAGE

子宮:2.60

胎盤:4.55

前立腺:4.03

卵巣:2.70

精巣:3.52

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:4.94

腸:4.43

結腸:4.46

肝臓:4.74

肺:6.75

膀胱:4.39

腎臓:-

下垂体:2.73

甲状腺:-

副腎:1.67

膵臓:2.03

乳腺:1.91

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:2.75

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:14.27

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001159900
Gene ID	74318
Unigene ID	Mm.181852
Probe set ID	1451776_s_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000059325

オーソログ対応遺伝子

ヒト[5]	NM_001145459, NM_001145460, NM_032495, NM_139211, NM_139212
ラット[1]	NM_133621, NM_001145460, NM_032495, NM_139211, NM_139212

染色体

5C3.3 [77,515,468 - 77,544,186]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356	Homeobox
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007507	heart development
GO:0016575	histone deacetylation
GO:0048286	lung alveolus development
GO:0007275	multicellular organismal development
GO:0045596	negative regulation of cell differentiation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0043415	positive regulation of skeletal muscle tissue regeneration
GO:0051155	positive regulation of striated muscle cell differentiation
GO:0008016	regulation of heart contraction
GO:0043393	regulation of protein binding
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0001829	trophectodermal cell differentiation

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003700	transcription factor activity

HOP homeobox

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function