sorting nexin 16

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同義遺伝子名

Snx16, AI747675, sorting nexin 16, 4930522N22Rik, Sorting nexin-16, AI117577

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:74.70 小脳:147.40 脳幹:349.60 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:57.30 脊柱:141.90 網膜:192.90 目:22.80 動脈:84.40 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:52.70 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:15.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.18 小脳:- 脳幹:3.28 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.19 網膜:- 目:- 動脈:1.98 静脈:- リンパ節:2.81 末梢血:- 脾臓:1.36 胸腺:1.69 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.69 皮膚:2.64
RNA-seq 大脳:2.22 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:23 精巣:81.30 心臓:18.60 骨格筋:71 食道:- 胃:32.70 腸:- 結腸:17.60     肝臓:9.10        肺:80.30    膀胱:- 腎臓:40.30 下垂体:219.60 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:58.80 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.07 胎盤:2.04 前立腺:3.06 卵巣:2.25 精巣:1.80 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.04 腸:1.84 結腸:2.07     肝臓:1.89    肺:2.23 膀胱:2.42 腎臓:- 下垂体:2.53 甲状腺:- 副腎:2.22 膵臓:2.56 乳腺:2.05 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.79        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001127191
Gene ID 74718
Unigene ID Mm.440548
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000027534

オーソログ対応遺伝子

ヒト[3]  NM_022133, NM_152836, NM_152837
ラット[1]  NM_022289, NM_152836, NM_152837

染色体

3A1  [10,417,819  -  10,440,124]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
12813048
15782199
16141072
16141073
21267068

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007154  cell communication
GO:0045022  early endosome to late endosome transport
GO:0008333  endosome to lysosome transport
GO:0006622  protein targeting to lysosome
GO:0015031  protein transport
GO:0006810  transport

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005769  early endosome
GO:0005768  endosome
GO:0031313  extrinsic to endosome membrane
GO:0005770  late endosome
GO:0005764  lysosome
GO:0016020  membrane

Molecular Function

GO:0042802  identical protein binding
GO:0008289  lipid binding
GO:0035091  phosphoinositide binding