Rtf1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

6530416A09Rik, AW553985, AI853581, Gtl7, 2900005O08Rik, Rtf1, AU043144, cbp82

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:79.90

小脳:36.80

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:19.10

脊柱:-

網膜:96.40

目:121.60

動脈:-

静脈:-

リンパ節:32.40

末梢血:28.80

脾臓:65.80

胸腺:59.30

骨髄:-

脂肪:-

骨:175.30

皮膚:23.80

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:3.72

小脳:-

脳幹:3.57

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:3.37

網膜:-

目:-

動脈:3.44

静脈:-

リンパ節:4.33

末梢血:-

脾臓:3.28

胸腺:3.43

骨髄:-

脂肪:-

骨:3.46

皮膚:4.53

RNA-seq

大脳:7.52

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:55.20

前立腺:-

卵巣:57.50

精巣:44.30

心臓:37.20

骨格筋:-

食道:-

胃:32.70

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:30.10

膀胱:-

腎臓:8.10

下垂体:155

甲状腺:-

副腎:424.40

膵臓:18.80

乳腺:58.80

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:3.35

胎盤:3.57

前立腺:2.91

卵巣:3.10

精巣:3.88

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:3.29

腸:3.02

結腸:2.95

肝臓:2.64

肺:3.30

膀胱:3.36

腎臓:-

下垂体:3.34

甲状腺:-

副腎:3.11

膵臓:2.90

乳腺:3.25

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:3.44

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:3.70

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_030112
Gene ID	76246
Unigene ID	Mm.33437
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSMUSG00000027304

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]	NM_015138
ラット[1]	NM_001108958

染色体

2E5 [119,500,804 - 119,561,143]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR004343	Plus-3
IPR018144	Plus-3 domain, subgroup

GO:0001711	endodermal cell fate commitment
GO:0016570	histone modification
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0051571	positive regulation of histone H3-K4 methylation
GO:0032968	positive regulation of RNA elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0019827	stem cell maintenance
GO:0006352	transcription initiation
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0016055	Wnt receptor signaling pathway

GO:0016593	Cdc73/Paf1 complex
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus

GO:0003677	DNA binding
GO:0003697	single-stranded DNA binding

Rtf1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function