Rtf1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

6530416A09Rik, AW553985, AI853581, Gtl7, 2900005O08Rik, Rtf1, AU043144, cbp82

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:79.90 小脳:36.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:19.10 脊柱:- 網膜:96.40 目:121.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:32.40 末梢血:28.80 脾臓:65.80 胸腺:59.30 骨髄:- 脂肪:- 骨:175.30 皮膚:23.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.72 小脳:- 脳幹:3.57 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.37 網膜:- 目:- 動脈:3.44 静脈:- リンパ節:4.33 末梢血:- 脾臓:3.28 胸腺:3.43 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.46 皮膚:4.53
RNA-seq nodata
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:55.20 前立腺:- 卵巣:57.50 精巣:44.30 心臓:37.20 骨格筋:- 食道:- 胃:32.70 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:30.10    膀胱:- 腎臓:8.10 下垂体:155 甲状腺:- 副腎:424.40 膵臓:18.80 乳腺:58.80 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.35 胎盤:3.57 前立腺:2.91 卵巣:3.10 精巣:3.88 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.29 腸:3.02 結腸:2.95     肝臓:2.64    肺:3.30 膀胱:3.36 腎臓:- 下垂体:3.34 甲状腺:- 副腎:3.11 膵臓:2.90 乳腺:3.25 唾液腺:-
RNA-seq nodata

詳細情報

IDs

Refseq ID XM_917502
Gene ID 76246
Unigene ID Mm.33437
Probe set ID -
Ensembl ID -

オーソログ対応遺伝子

ヒト [0]  
ラット [0]  

染色体

2E5  [119,500,804  -  119,561,143]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR004343  Plus-3
IPR018144  Plus-3 domain, subgroup

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
9701556
10349636
10725249
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
12904583
14610273
15226823
15782199
16141072
16141073
17967808
18184592
18799693
19345177
21267068
21677750
24036311

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0001711  endodermal cell fate commitment
GO:0016570  histone modification
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0051571  positive regulation of histone H3-K4 methylation
GO:0032968  positive regulation of RNA elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0019827  stem cell maintenance
GO:0006352  transcription initiation
GO:0006351  transcription, DNA-dependent
GO:0016055  Wnt receptor signaling pathway

Cellular Component

GO:0016593  Cdc73/Paf1 complex
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0003697  single-stranded DNA binding