SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 2

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同義遺伝子名

Smarcd2, AW322457, 60 kDa BRG-1/Brm-associated factor subunit B, Baf60b, BRG1-associated factor 60B

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:10.40 小脳:55.30 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:38.20 脊柱:- 網膜:64.30 目:106.40 動脈:84.40 静脈:- リンパ節:- 末梢血:57.50 脾臓:13.20 胸腺:128.40 骨髄:12.80 脂肪:- 骨:87.70 皮膚:110.80
GeneChip 大脳:7.26 小脳:9.96 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.69 脊柱:7.68 網膜:10.37 目:11.11 動脈:- 静脈:10.99 リンパ節:10.90 末梢血:- 脾臓:11.13 胸腺:- 骨髄:11 脂肪:9.60 骨:11.07 皮膚:11.24
CAGE 大脳:2.85 小脳:- 脳幹:2.14 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.58 網膜:- 目:- 動脈:2.82 静脈:- リンパ節:2.84 末梢血:- 脾臓:3.75 胸腺:4.45 骨髄:- 脂肪:- 骨:4.13 皮膚:3.67
RNA-seq 大脳:3.84 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:13.80 前立腺:- 卵巣:137.90 精巣:14.80 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:32.70 腸:- 結腸:264.30     肝臓:54.30        肺:291.20    膀胱:132.40 腎臓:64.50 下垂体:12.90 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:65.70 乳腺:346.10 唾液腺:216
GeneChip 子宮:10.78 胎盤:9.78 前立腺:10.63 卵巣:10.25 精巣:9.24 心臓:8.42 骨格筋:8.12 食道:- 胃:9.90 腸:10.48 結腸:- 肝臓:9.87 肺:9.95 膀胱:10.27 腎臓:8.80 下垂体:9.58 甲状腺:- 副腎:10.90 膵臓:10.01 乳腺:10.59 唾液腺:11.49
CAGE 子宮:3.82 胎盤:3.39 前立腺:3.72 卵巣:3.55 精巣:3.75 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.57 腸:3.57 結腸:3.90     肝臓:3.76    肺:3.59 膀胱:3.58 腎臓:- 下垂体:3.06 甲状腺:- 副腎:3.44 膵臓:2.97 乳腺:4.02 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:3.03 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:10.47        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001130187
Gene ID 83796
Unigene ID Mm.21772
Probe set ID 1448400_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000078619

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_001098426
ラット [0]  

染色体

11E1  [106,124,493  -  106,134,286]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR019835  SWIB domain
IPR003121  SWIB/MDM2 domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

2055486
10349636
11042159
11076861
11217851
12368262
12466851
12477932
15489334
15525990
15618518
15782199
16141072
16141073
16602821
17015433
18287559
19494835
20148946
20362541
20412781
21267068
22174793

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0006337  nucleosome disassembly
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus
GO:0016514  SWI/SNF complex

Molecular Function

GO:0003674  molecular_function