lysyl-tRNA synthetase

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同義遺伝子名

D8Wsu108e, AL033315, Lysyl-tRNA synthetase, D8Ertd698e, AA589550, AL024334, lysyl-tRNA synthetase, Lysine--tRNA ligase, AL033367, LysRS, mKIAA0070, Kars

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:135.50 小脳:92.10 脳幹:190.70 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:114.70 脊柱:- 網膜:321.40 目:98.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:21.60 末梢血:287.50 脾臓:52.70 胸腺:148.20 骨髄:218 脂肪:- 骨:87.70 皮膚:134.60
GeneChip 大脳:8.91 小脳:8.69 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:9.29 脊柱:9.21 網膜:8.72 目:8.98 動脈:- 静脈:9.40 リンパ節:9.80 末梢血:- 脾臓:9.48 胸腺:- 骨髄:9.65 脂肪:9.36 骨:9.59 皮膚:9.02
CAGE nodata
RNA-seq 大脳:15.72 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:130.90 胎盤:179.50 前立腺:30.90 卵巣:46 精巣:103.50 心臓:130.20 骨格筋:284.10 食道:- 胃:- 腸:73.90 結腸:35.20     肝臓:99.60        肺:160.70    膀胱:198.50 腎臓:153.10 下垂体:38.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:159.50 乳腺:160 唾液腺:108
GeneChip 子宮:10.08 胎盤:8.77 前立腺:10.20 卵巣:9.74 精巣:9.56 心臓:9.35 骨格筋:9.99 食道:- 胃:9.27 腸:9.81 結腸:- 肝臓:9.20 肺:9.12 膀胱:9.28 腎臓:8.95 下垂体:9.53 甲状腺:- 副腎:9.07 膵臓:9.95 乳腺:9.82 唾液腺:9.55
CAGE nodata
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:21.82 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:14.06        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

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IDs

Refseq ID NM_001130868
Gene ID 85305
Unigene ID Mm.196544
Probe set ID 1416068_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000031948

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]  NM_001130089, NM_005548
ラット [0]  

染色体

8E1  [114,517,340  -  114,535,223]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR004364  Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N)
IPR018150  Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N)-like
IPR006195  Aminoacyl-tRNA synthetase, class II, conserved domain
IPR002312  Aspartyl-tRNA synthetase, class IIb
IPR018149  Lysyl-tRNA synthetase, class II, C-terminal

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7671812
9811942
10349636
10725249
10922068
11042159
11076861
11217851
11331948
12466851
12477932
12819125
12904583
14610273
14621295
14681479
15489334
16141072
16141073
16199869
16291755
17967808
18614015
18715867
18799693
21267068
22673621

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0015966  diadenosine tetraphosphate biosynthetic process
GO:0006430  lysyl-tRNA aminoacylation
GO:0006412  translation
GO:0006418  tRNA aminoacylation for protein translation

Cellular Component

GO:0017101  aminoacyl-tRNA synthetase multienzyme complex
GO:0005737  cytoplasm
GO:0015630  microtubule cytoskeleton
GO:0005739  mitochondrion

Molecular Function

GO:0016597  amino acid binding
GO:0004812  aminoacyl-tRNA ligase activity
GO:0005524  ATP binding
GO:0016874  ligase activity
GO:0004824  lysine-tRNA ligase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0000049  tRNA binding