SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5

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同義遺伝子名

4933427E24Rik, D330027N15Rik, D030040M08Rik, Snf2h, mSnf2h, Smarca5, Sucrose nonfermenting protein 2 homolog

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:8.84

小脳:8.59

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:8.65

脊柱:8.47

網膜:9.82

目:9.59

動脈:-

静脈:9.48

リンパ節:10.11

末梢血:-

脾臓:9.72

胸腺:-

骨髄:10.84

脂肪:8.89

骨:10.59

皮膚:9.40

CAGE

大脳:1.32

小脳:-

脳幹:1.10

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:1.23

網膜:-

目:-

動脈:0.54

静脈:-

リンパ節:1.28

末梢血:-

脾臓:1.17

胸腺:1.43

骨髄:-

脂肪:-

骨:1.97

皮膚:0.91

RNA-seq

大脳:2.95

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:9.76

胎盤:9.64

前立腺:9.48

卵巣:9.96

精巣:9.96

心臓:8.70

骨格筋:8.51

食道:-

胃:9.29

腸:9.60

結腸:-

肝臓:8.76

肺:9.14

膀胱:9.07

腎臓:8.52

下垂体:9.87

甲状腺:-

副腎:10

膵臓:8.73

乳腺:9.09

唾液腺:9.35

CAGE

子宮:0.55

胎盤:1.14

前立腺:0.37

卵巣:0.88

精巣:0.45

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:0.67

腸:0.72

結腸:0.93

肝臓:0.64

肺:0.75

膀胱:0.68

腎臓:-

下垂体:0.99

甲状腺:-

副腎:0.37

膵臓:0.84

乳腺:0.56

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:3.01

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:6.83

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_053124
Gene ID	93762
Unigene ID	-
Probe set ID	1424206_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000031715

オーソログ対応遺伝子

ヒト[6]	NM_003601
ラット [0]

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related
IPR001005	SANT, DNA-binding

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006200	ATP catabolic process
GO:0043044	ATP-dependent chromatin remodeling
GO:0006333	chromatin assembly or disassembly
GO:0016568	chromatin modification
GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0000183	chromatin silencing at rDNA
GO:0006302	double-strand break repair
GO:0009790	embryonic development
GO:0006334	nucleosome assembly
GO:0016584	nucleosome positioning
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006352	transcription initiation

Cellular Component

GO:0005677	chromatin silencing complex
GO:0000793	condensed chromosome
GO:0043596	nuclear replication fork
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0016589	NURF complex
GO:0031213	RSF complex

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0016887	ATPase activity
GO:0003682	chromatin binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0004386	helicase activity
GO:0042393	histone binding
GO:0016787	hydrolase activity
GO:0016817	hydrolase activity, acting on acid anhydrides
GO:0016818	hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides
GO:0003676	nucleic acid binding
GO:0031491	nucleosome binding
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding

SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function