bromodomain and WD repeat domain containing 1

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同義遺伝子名

Wdr9, Brwd1, bromodomain and WD repeat domain containing 1, WD repeat protein 9, D530019K20Rik, 5330419I02Rik

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:99 小脳:128.90 脳幹:158.90 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:47.30 網膜:128.60 目:121.60 動脈:84.40 静脈:- リンパ節:43.20 末梢血:172.50 脾臓:118.50 胸腺:98.80 骨髄:38.50 脂肪:- 骨:75.10 皮膚:87.10
GeneChip 大脳:8.54 小脳:8.52 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.88 脊柱:8.07 網膜:8.41 目:7.36 動脈:- 静脈:8.07 リンパ節:8.55 末梢血:- 脾臓:8.93 胸腺:- 骨髄:7 脂肪:7.30 骨:7.23 皮膚:8.82
CAGE 大脳:3.96 小脳:- 脳幹:3.81 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.88 網膜:- 目:- 動脈:3.45 静脈:- リンパ節:4.10 末梢血:- 脾臓:3.37 胸腺:3.78 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.44 皮膚:3.58
RNA-seq 大脳:5.15 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:87.20 胎盤:82.80 前立腺:61.80 卵巣:241.30 精巣:73.90 心臓:74.40 骨格筋:- 食道:- 胃:65.50 腸:- 結腸:70.50     肝臓:9.10        肺:80.30    膀胱:198.50 腎臓:- 下垂体:77.50 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:197 乳腺:75.10 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.34 胎盤:7.86 前立腺:8.71 卵巣:8.25 精巣:6.09 心臓:6.46 骨格筋:6.83 食道:- 胃:7.70 腸:7.61 結腸:- 肝臓:7.13 肺:7.66 膀胱:7.98 腎臓:7.34 下垂体:8.59 甲状腺:- 副腎:8.22 膵臓:7.59 乳腺:7.78 唾液腺:7.75
CAGE 子宮:3.72 胎盤:3.91 前立腺:3.80 卵巣:3.76 精巣:3.35 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.52 腸:3.36 結腸:3.35     肝臓:3.47    肺:3.61 膀胱:3.68 腎臓:- 下垂体:3.85 甲状腺:- 副腎:3.57 膵臓:4.23 乳腺:3.67 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.33 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.81        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_145125
Gene ID 93871
Unigene ID Mm.240871
Probe set ID 1427322_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000022914

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]  NM_001007246, NM_018963, NM_033656
ラット[4]  NM_001007246, NM_018963, NM_033656

染色体

16C4  [96,213,699  -  96,304,133]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001680  WD40 repeat
IPR019782  WD40 repeat 2
IPR019781  WD40 repeat, subgroup
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
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11544199
12359327
12466851
12466854
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12889071
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14681479
15475267
15782199
16033648
16141072
16141073
16452087
18353305
18799693
18973680
20362542
21267068
21677750

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007010  cytoskeleton organization
GO:0008360  regulation of cell shape
GO:0006357  regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005515  protein binding