tripartite motif-containing 16

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同義遺伝子名

tripartite motif protein 16, Ebbp, AI482483, Tripartite motif-containing protein 16, 9130006M08Rik, Estrogen-responsive B box protein, Trim16, EBBP

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:6.90 小脳:36.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:141.90 網膜:96.40 目:22.80 動脈:168.80 静脈:- リンパ節:- 末梢血:43.10 脾臓:- 胸腺:49.40 骨髄:- 脂肪:- 骨:87.70 皮膚:31.70
GeneChip 大脳:4.33 小脳:4.59 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:5.50 脊柱:4.93 網膜:4.18 目:5.51 動脈:- 静脈:5.63 リンパ節:4.21 末梢血:- 脾臓:4.23 胸腺:- 骨髄:5.51 脂肪:5.92 骨:5.42 皮膚:6.57
CAGE 大脳:0.96 小脳:- 脳幹:1.72 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:1.82 網膜:- 目:- 動脈:3.21 静脈:- リンパ節:1.28 末梢血:- 脾臓:0.71 胸腺:0.95 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.09 皮膚:3.06
RNA-seq 大脳:1.48 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:43.60 胎盤:- 前立腺:30.90 卵巣:11.50 精巣:177.40 心臓:37.20 骨格筋:- 食道:- 胃:32.70 腸:- 結腸:35.20     肝臓:9.10        肺:70.30    膀胱:132.40 腎臓:56.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:9.40 乳腺:52.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.07 胎盤:5.28 前立腺:6.45 卵巣:5.05 精巣:4.15 心臓:5.06 骨格筋:7.35 食道:- 胃:7.34 腸:7.31 結腸:- 肝臓:4.48 肺:8.02 膀胱:6.39 腎臓:4.78 下垂体:4.90 甲状腺:- 副腎:5.07 膵臓:5.19 乳腺:6.16 唾液腺:5.41
CAGE 子宮:2.87 胎盤:2.07 前立腺:2.90 卵巣:1.86 精巣:0 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.64 腸:2.90 結腸:3.13     肝臓:0.26    肺:3.95 膀胱:3.02 腎臓:- 下垂体:1.75 甲状腺:- 副腎:1.67 膵臓:3.10 乳腺:2.62 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:3.34 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:0        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_053169
Gene ID 94092
Unigene ID Mm.117087
Probe set ID 1460629_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000047821

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001037330, NM_006470
ラット[1]  NM_001135033, NM_006470

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001870  B302 (SPRY)-like
IPR003879  Butyrophylin-like
IPR003877  SPla/RYanodine receptor SPRY
IPR018355  SPla/RYanodine receptor subgroup
IPR000315  Zinc finger, B-box

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
11042159
11076861
11217851
11331580
11919186
12466851
12477932
14681479
15489334
15618518
15937080
16141072
16141073
18287559
21267068
23341783

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043966  histone H3 acetylation
GO:0043967  histone H4 acetylation
GO:0050718  positive regulation of interleukin-1 beta secretion
GO:0045618  positive regulation of keratinocyte differentiation
GO:0048386  positive regulation of retinoic acid receptor signaling pathway
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0060416  response to growth hormone stimulus

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005622  intracellular
GO:0016605  PML body

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0019966  interleukin-1 binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0032089  NACHT domain binding
GO:0008270  zinc ion binding