heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F

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同義遺伝子名

Hnrpf, MGC101981, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, 4833420I20Rik, AA407306, MGC36971, hnRNP F, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:97.20 小脳:92.10 脳幹:127.10 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:114.70 脊柱:378.30 網膜:192.90 目:197.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:32.40 末梢血:891.40 脾臓:171.20 胸腺:306.30 骨髄:192.30 脂肪:212.70 骨:212.90 皮膚:166.30
GeneChip 大脳:9.63 小脳:10.06 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:10.07 脊柱:9.35 網膜:10.83 目:11.14 動脈:- 静脈:11.50 リンパ節:11.76 末梢血:- 脾臓:11.94 胸腺:- 骨髄:11.80 脂肪:10.84 骨:12.10 皮膚:11.96
CAGE 大脳:4.30 小脳:- 脳幹:4.15 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:4.30 網膜:- 目:- 動脈:5.09 静脈:- リンパ節:6.00 末梢血:- 脾臓:5.87 胸腺:6.10 骨髄:- 脂肪:- 骨:5.80 皮膚:5.08
RNA-seq 大脳:11.99 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:392.60 胎盤:138.10 前立腺:92.60 卵巣:275.80 精巣:184.70 心臓:111.60 骨格筋:213 食道:- 胃:163.60 腸:- 結腸:88.10     肝臓:27.20        肺:291.20    膀胱:66.20 腎臓:201.50 下垂体:439.20 甲状腺:224.90 副腎:- 膵臓:112.60 乳腺:326.50 唾液腺:108
GeneChip 子宮:11.55 胎盤:11.18 前立腺:11.48 卵巣:11.48 精巣:10.13 心臓:10.06 骨格筋:9.85 食道:- 胃:11.23 腸:11.40 結腸:- 肝臓:10.55 肺:11.38 膀胱:11.29 腎臓:10.69 下垂体:10.60 甲状腺:- 副腎:11.37 膵臓:11.25 乳腺:11.16 唾液腺:11.98
CAGE 子宮:5.38 胎盤:5.32 前立腺:5.51 卵巣:5.22 精巣:6.92 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:5.67 腸:5.60 結腸:5.58     肝臓:5.47    肺:5.53 膀胱:5.21 腎臓:- 下垂体:4.68 甲状腺:- 副腎:4.80 膵臓:4.93 乳腺:5.42 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:11.05 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:23.92        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001166428
Gene ID 98758
Unigene ID Mm.422979
Probe set ID 1456664_x_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000042079

オーソログ対応遺伝子

ヒト[12]  NM_001098204, NM_001098205, NM_001098206, NM_001098207, NM_001098208, NM_004966
ラット[12]  NM_001098204, NM_001098205, NM_001098206, NM_001098207, NM_001098208, NM_004966

染色体

6F1  [117,850,358  -  117,875,639]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
11042159
11076861
11217851
11544199
12466851
12477932
12520002
12819125
12904583
14610273
15489334
15782199
16033648
16141072
16141073
18799693
19164599
20975687
21565611
21625959
21677750
21739230
22128153
22664958
23284676
23649778
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006397  mRNA processing
GO:0043484  regulation of RNA splicing
GO:0008380  RNA splicing

Cellular Component

GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0030529  ribonucleoprotein complex
GO:0005681  spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0003727  single-stranded RNA binding
GO:0017025  TATA-binding protein binding