chromobox homolog 5 (HP1 alpha homolog, Drosophila)

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同義遺伝子名

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発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:6.13 小脳:5.78 脳幹:6.37 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:6.34 脊柱:- 網膜:- 目:5.91 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:5.70 胸腺:6.76 骨髄:5.79 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:5.73 骨格筋:5.51 食道:- 胃:- 腸:5.47 結腸:5.76 肝臓:- 肺:- 膀胱:- 腎臓:5.62 下垂体:7.31 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001106797
Gene ID 300266
Unigene ID -
Probe set ID rc_AA893788_at  [RG_U34A]
Ensembl ID ENSRNOG00000036841

オーソログ対応遺伝子

ヒト[6]  NM_001127321, NM_001127322, NM_012117
マウス[12]  NM_001076789, NM_001110216, NM_007626

染色体

7q36  [142,107,923  -  142,125,543]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000953  Chromo domain
IPR017984  Chromo domain subgroup
IPR016197  Chromo domain-like
IPR008251  Chromo shadow
IPR018125  Chromo shadow, subgroup

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

12477932

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0010369  chromocenter
GO:0005737  cytoplasm
GO:0000792  heterochromatin
GO:0000118  histone deacetylase complex
GO:0035097  histone methyltransferase complex
GO:0000776  kinetochore
GO:0005720  nuclear heterochromatin
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0016605  PML body
GO:0017053  transcriptional repressor complex

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0019899  enzyme binding
GO:0042826  histone deacetylase binding
GO:0035064  methylated histone residue binding
GO:0030674  protein binding, bridging
GO:0042803  protein homodimerization activity
GO:0070491  transcription repressor binding