excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 8

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同義遺伝子名

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発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:119.60 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:110.60 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:78 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:5.54 小脳:5.64 脳幹:5.30 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:6.15 脊柱:- 網膜:- 目:4.95 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:5.13 胸腺:5.28 骨髄:4.91 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:82.30 心臓:38.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:56.90 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:4.96 骨格筋:5.16 食道:- 胃:- 腸:4.70 結腸:4.95 肝臓:- 肺:- 膀胱:- 腎臓:4.67 下垂体:5.96 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001107650
Gene ID 310071
Unigene ID Rn.107979
Probe set ID rc_AA800156_at  [RG_U34A]
Ensembl ID ENSRNOG00000009968

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_000082
マウス[3]  NM_028042

染色体

2q14  [39,382,976  -  39,420,764]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472  G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR001680  WD40 repeat
IPR019782  WD40 repeat 2
IPR019781  WD40 repeat, subgroup
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

12477932
18166977
22824526

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008150  biological_process
GO:0045739  positive regulation of DNA repair
GO:0043161  proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0051865  protein autoubiquitination
GO:0000209  protein polyubiquitination
GO:0006979  response to oxidative stress
GO:0009411  response to UV
GO:0010165  response to X-ray
GO:0006283  transcription-coupled nucleotide-excision repair

Cellular Component

GO:0005575  cellular_component
GO:0031464  Cul4A-RING ubiquitin ligase complex
GO:0016363  nuclear matrix
GO:0000109  nucleotide-excision repair complex

Molecular Function

GO:0003674  molecular_function
GO:0032403  protein complex binding
GO:0004842  ubiquitin-protein ligase activity