cold shock domain protein A

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同義遺伝子名

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発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:47.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:36.90 脊柱:- 網膜:- 目:177.70 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:702 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:147.20 骨:273.30 皮膚:-
GeneChip 大脳:7.80 小脳:7.70 脳幹:7.43 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.62 脊柱:- 網膜:- 目:9.86 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:10.42 胸腺:8.91 骨髄:11.63 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:477.90 前立腺:189.80 卵巣:114.10 精巣:494.10 心臓:155.10 骨格筋:1594.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:79.80        肺:152    膀胱:1129.90 腎臓:- 下垂体:59.20 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:9.65 骨格筋:11.24 食道:- 胃:- 腸:8.59 結腸:10.18 肝臓:- 肺:- 膀胱:- 腎臓:8.88 下垂体:8.84 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_031979
Gene ID 83807
Unigene ID Rn.3306
Probe set ID D28557_s_at  [RG_U34A]
Ensembl ID ENSRNOG00000005480

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]  NM_001145426, NM_003651
マウス[4]  NM_011733, NM_139117

染色体

4q42  [169,076,514  -  169,099,854]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR011129  Cold shock protein
IPR002059  Cold-shock protein, DNA-binding
IPR007118  Expansin/Lol pI
IPR005795  Major pollen allergen Lol pI
IPR016027  Nucleic acid-binding, OB-fold-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8029009
8636158
11675468
11750989
12477932
15592429
16650609

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0071474  cellular hyperosmotic response
GO:0071356  cellular response to tumor necrosis factor
GO:0009566  fertilization
GO:0001701  in utero embryonic development
GO:0008584  male gonad development
GO:0043066  negative regulation of apoptosis
GO:0060547  negative regulation of necrotic cell death
GO:0048642  negative regulation of skeletal muscle tissue development
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0031100  organ regeneration
GO:0046622  positive regulation of organ growth
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007283  spermatogenesis
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005921  gap junction
GO:0005634  nucleus
GO:0005844  polysome
GO:0030529  ribonucleoprotein complex

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0003730  mRNA 3'-UTR binding
GO:0003697  single-stranded DNA binding