synaptojanin 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

-

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:323 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:258.10 脊柱:- 網膜:- 目:213.20 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:122.90 骨髄:- 脂肪:- 骨:39 皮膚:-
GeneChip 大脳:7.83 小脳:8.25 脳幹:8.22 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.11 脊柱:- 網膜:- 目:6.78 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:6.76 胸腺:6.83 骨髄:7.01 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:39.80 前立腺:38 卵巣:114.10 精巣:164.70 心臓:58.20 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:104.70 結腸:-     肝臓:-        肺:50.70    膀胱:- 腎臓:63.80 下垂体:236.90 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:6.72 骨格筋:7.09 食道:- 胃:- 腸:6.83 結腸:6.61 肝臓:- 肺:- 膀胱:- 腎臓:6.98 下垂体:7.40 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_053476
Gene ID 85238
Unigene ID Rn.22685
Probe set ID AJ006855_s_at  [RG_U34A]
Ensembl ID ENSRNOG00000002051

オーソログ対応遺伝子

ヒト[7]  NM_001160302, NM_001160306, NM_003895, NM_203446
マウス[2]  NM_001045515, NM_001164483, NM_003895, NM_203446

染色体

11q11  [30,921,849  -  30,997,674]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR005135  Endonuclease/exonuclease/phosphatase
IPR000300  Inositol polyphosphate related phosphatase
IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1
IPR017997  Vinculin
IPR006077  Vinculin/alpha-catenin

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8552192
8798761
9195986
9238017
9341169
9428629
9694653
9710239
9813051
9931483
9950691
10764144
11498538
11665617
14704270
15659545
15821731
17257598
17762867
19282871
20448150
22871113

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007420  brain development
GO:0006897  endocytosis
GO:0046855  inositol phosphate dephosphorylation
GO:0007612  learning
GO:0006836  neurotransmitter transport
GO:0046488  phosphatidylinositol metabolic process
GO:0046856  phosphoinositide dephosphorylation
GO:0014015  positive regulation of gliogenesis
GO:0048260  positive regulation of receptor-mediated endocytosis
GO:0034097  response to cytokine stimulus
GO:0032526  response to retinoic acid
GO:0048488  synaptic vesicle endocytosis
GO:0016082  synaptic vesicle priming
GO:0048489  synaptic vesicle transport
GO:0016191  synaptic vesicle uncoating

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0030117  membrane coat
GO:0043005  neuron projection
GO:0043234  protein complex

Molecular Function

GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0004439  phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity
GO:0034595  phosphoinositide 5-phosphatase activity
GO:0042578  phosphoric ester hydrolase activity
GO:0005515  protein binding
GO:0008022  protein C-terminus binding
GO:0032403  protein complex binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0017124  SH3 domain binding